Di Budokan, sebuah acara tahunan yang dikenal sebagai Konser Tsukino menampilkan unit-unit idola terbaik dan terpopuler dari Tsukino Entertainment Production di atas panggung. Para pemimpin grup idola SolidS, SOARA, QUELL, dan Growth harus menciptakan empat lagu unik dan khas untuk unit mereka masing-masing, yang akan mereka tampilkan pada hari kedua festival.
Menciptakan empat lagu baru terbukti menjadi tugas yang sulit bagi pemimpin SolidS, Shiki Takamura, karena ia kesulitan menemukan inspirasi. Sora Oohara harus belajar mengatasi kesalahan masa lalu sambil mendorong unitnya, SOARA, ke puncak. Ingin melepaskan diri dari ketenaran masa lalunya, Shuu Izumi bertekad untuk mendorong unitnya, QUELL, ke tingkat popularitas yang pernah dicapai unitnya sebelumnya. Growth mendapati diri mereka bekerja sama dengan grup saingan, ZIX, sebelum debut mereka—sesuatu yang enggan dilakukan oleh pemimpinnya, Kouki Etou.
Tsukipro The Animation menceritakan kisah keempat unit ini secara bersamaan saat mereka menjalani kehidupan sehari-hari sambil mempersiapkan Konser Tsukino.